Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top1Q04750 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top1Q04750 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top1Q04750 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top1Q04750 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top1Q04750 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Top1Q04750 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top1Q04750 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Top1Q04750 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top1Q04750 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top1Q04750 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Top1Q04750 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top1Q04750 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Top1Q04750 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top1Q04750 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top1Q04750 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top1Q04750 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top1Q04750 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top1Q04750 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top1Q04750 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top1Q04750 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top1Q04750 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top1Q04750 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Top1Q04750 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top1Q04750 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top1Q04750 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top1Q04750 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top1Q04750 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top1Q04750 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top1Q04750 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top1Q04750 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top1Q04750 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top1Q04750 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top1Q04750 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top1Q04750 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top1Q04750 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top1Q04750 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top1Q04750 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top1Q04750 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top1Q04750 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top1Q04750 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top1Q04750 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top1Q04750 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Top1Q04750 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top1Q04750 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Top1Q04750 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Top1Q04750 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top1Q04750 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top1Q04750 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top1Q04750 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top1Q04750 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top1Q04750 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top1Q04750 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top1Q04750 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top1Q04750 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top1Q04750 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top1Q04750 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top1Q04750 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Top1Q04750 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top1Q04750 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top1Q04750 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top1Q04750 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top1Q04750 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top1Q04750 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top1Q04750 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top1Q04750 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top1Q04750 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top1Q04750 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top1Q04750 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top1Q04750 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Top1Q04750 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top1Q04750 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top1Q04750 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top1Q04750 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top1Q04750 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top1Q04750 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top1Q04750 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms