Protein–RNA interactions for Protein: Q03288

Asip, Agouti-signaling protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AsipQ03288 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AsipQ03288 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AsipQ03288 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AsipQ03288 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AsipQ03288 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AsipQ03288 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AsipQ03288 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AsipQ03288 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AsipQ03288 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AsipQ03288 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AsipQ03288 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AsipQ03288 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AsipQ03288 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AsipQ03288 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AsipQ03288 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AsipQ03288 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AsipQ03288 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AsipQ03288 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AsipQ03288 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AsipQ03288 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AsipQ03288 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AsipQ03288 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AsipQ03288 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AsipQ03288 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AsipQ03288 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AsipQ03288 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AsipQ03288 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AsipQ03288 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AsipQ03288 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
AsipQ03288 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AsipQ03288 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AsipQ03288 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AsipQ03288 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AsipQ03288 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AsipQ03288 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AsipQ03288 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AsipQ03288 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AsipQ03288 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AsipQ03288 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AsipQ03288 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AsipQ03288 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AsipQ03288 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AsipQ03288 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AsipQ03288 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AsipQ03288 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AsipQ03288 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AsipQ03288 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AsipQ03288 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AsipQ03288 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AsipQ03288 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AsipQ03288 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AsipQ03288 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AsipQ03288 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AsipQ03288 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AsipQ03288 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AsipQ03288 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AsipQ03288 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AsipQ03288 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AsipQ03288 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AsipQ03288 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AsipQ03288 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AsipQ03288 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AsipQ03288 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AsipQ03288 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AsipQ03288 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AsipQ03288 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AsipQ03288 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AsipQ03288 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AsipQ03288 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AsipQ03288 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AsipQ03288 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AsipQ03288 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms