Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp10Q000W5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp10Q000W5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp10Q000W5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp10Q000W5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp10Q000W5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp10Q000W5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp10Q000W5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp10Q000W5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp10Q000W5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp10Q000W5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp10Q000W5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp10Q000W5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gbp10Q000W5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp10Q000W5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp10Q000W5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp10Q000W5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp10Q000W5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp10Q000W5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp10Q000W5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp10Q000W5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp10Q000W5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp10Q000W5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp10Q000W5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp10Q000W5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp10Q000W5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp10Q000W5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp10Q000W5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp10Q000W5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp10Q000W5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp10Q000W5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp10Q000W5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp10Q000W5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp10Q000W5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp10Q000W5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp10Q000W5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp10Q000W5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp10Q000W5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp10Q000W5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp10Q000W5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbp10Q000W5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbp10Q000W5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp10Q000W5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp10Q000W5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp10Q000W5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp10Q000W5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp10Q000W5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp10Q000W5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp10Q000W5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp10Q000W5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp10Q000W5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gbp10Q000W5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp10Q000W5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp10Q000W5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp10Q000W5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp10Q000W5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp10Q000W5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp10Q000W5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp10Q000W5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp10Q000W5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp10Q000W5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp10Q000W5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp10Q000W5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms