Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AurkaP97477 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AurkaP97477 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AurkaP97477 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AurkaP97477 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AurkaP97477 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AurkaP97477 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AurkaP97477 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AurkaP97477 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AurkaP97477 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AurkaP97477 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AurkaP97477 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AurkaP97477 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AurkaP97477 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AurkaP97477 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AurkaP97477 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AurkaP97477 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AurkaP97477 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AurkaP97477 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AurkaP97477 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AurkaP97477 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AurkaP97477 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AurkaP97477 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AurkaP97477 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AurkaP97477 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AurkaP97477 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
AurkaP97477 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AurkaP97477 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AurkaP97477 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AurkaP97477 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AurkaP97477 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AurkaP97477 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AurkaP97477 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AurkaP97477 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AurkaP97477 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AurkaP97477 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AurkaP97477 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AurkaP97477 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AurkaP97477 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AurkaP97477 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AurkaP97477 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AurkaP97477 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AurkaP97477 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AurkaP97477 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AurkaP97477 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AurkaP97477 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AurkaP97477 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AurkaP97477 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AurkaP97477 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AurkaP97477 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AurkaP97477 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AurkaP97477 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AurkaP97477 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AurkaP97477 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AurkaP97477 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AurkaP97477 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AurkaP97477 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AurkaP97477 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AurkaP97477 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AurkaP97477 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AurkaP97477 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AurkaP97477 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AurkaP97477 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AurkaP97477 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AurkaP97477 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AurkaP97477 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AurkaP97477 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AurkaP97477 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AurkaP97477 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AurkaP97477 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AurkaP97477 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AurkaP97477 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AurkaP97477 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AurkaP97477 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AurkaP97477 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AurkaP97477 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AurkaP97477 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AurkaP97477 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
AurkaP97477 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AurkaP97477 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
AurkaP97477 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AurkaP97477 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AurkaP97477 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AurkaP97477 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AurkaP97477 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AurkaP97477 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AurkaP97477 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AurkaP97477 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AurkaP97477 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AurkaP97477 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AurkaP97477 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AurkaP97477 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AurkaP97477 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AurkaP97477 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AurkaP97477 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AurkaP97477 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AurkaP97477 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AurkaP97477 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AurkaP97477 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AurkaP97477 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms