Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NyxP83503 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NyxP83503 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NyxP83503 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NyxP83503 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NyxP83503 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NyxP83503 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NyxP83503 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NyxP83503 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NyxP83503 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NyxP83503 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NyxP83503 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NyxP83503 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NyxP83503 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NyxP83503 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NyxP83503 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NyxP83503 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NyxP83503 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NyxP83503 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NyxP83503 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NyxP83503 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NyxP83503 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NyxP83503 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NyxP83503 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NyxP83503 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NyxP83503 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NyxP83503 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NyxP83503 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
NyxP83503 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NyxP83503 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NyxP83503 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NyxP83503 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NyxP83503 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NyxP83503 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NyxP83503 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NyxP83503 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NyxP83503 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NyxP83503 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NyxP83503 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NyxP83503 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NyxP83503 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NyxP83503 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NyxP83503 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NyxP83503 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NyxP83503 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NyxP83503 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NyxP83503 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NyxP83503 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NyxP83503 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NyxP83503 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NyxP83503 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NyxP83503 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NyxP83503 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NyxP83503 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NyxP83503 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NyxP83503 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NyxP83503 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
NyxP83503 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NyxP83503 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NyxP83503 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NyxP83503 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NyxP83503 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
NyxP83503 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NyxP83503 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
NyxP83503 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NyxP83503 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NyxP83503 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NyxP83503 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NyxP83503 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NyxP83503 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NyxP83503 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NyxP83503 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NyxP83503 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NyxP83503 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NyxP83503 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NyxP83503 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NyxP83503 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NyxP83503 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NyxP83503 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NyxP83503 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NyxP83503 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NyxP83503 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NyxP83503 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NyxP83503 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NyxP83503 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NyxP83503 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NyxP83503 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NyxP83503 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NyxP83503 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NyxP83503 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NyxP83503 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NyxP83503 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NyxP83503 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NyxP83503 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NyxP83503 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NyxP83503 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NyxP83503 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NyxP83503 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NyxP83503 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NyxP83503 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms