Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SgcdP82347 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SgcdP82347 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SgcdP82347 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SgcdP82347 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SgcdP82347 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SgcdP82347 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SgcdP82347 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SgcdP82347 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SgcdP82347 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SgcdP82347 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SgcdP82347 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SgcdP82347 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SgcdP82347 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SgcdP82347 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SgcdP82347 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgcdP82347 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgcdP82347 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgcdP82347 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SgcdP82347 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SgcdP82347 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SgcdP82347 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SgcdP82347 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SgcdP82347 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SgcdP82347 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SgcdP82347 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SgcdP82347 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SgcdP82347 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SgcdP82347 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SgcdP82347 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SgcdP82347 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SgcdP82347 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SgcdP82347 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SgcdP82347 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SgcdP82347 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SgcdP82347 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SgcdP82347 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SgcdP82347 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SgcdP82347 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SgcdP82347 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SgcdP82347 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SgcdP82347 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SgcdP82347 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SgcdP82347 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SgcdP82347 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SgcdP82347 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SgcdP82347 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SgcdP82347 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SgcdP82347 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SgcdP82347 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SgcdP82347 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SgcdP82347 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SgcdP82347 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SgcdP82347 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SgcdP82347 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SgcdP82347 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SgcdP82347 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SgcdP82347 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SgcdP82347 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SgcdP82347 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SgcdP82347 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SgcdP82347 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SgcdP82347 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SgcdP82347 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SgcdP82347 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SgcdP82347 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SgcdP82347 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SgcdP82347 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SgcdP82347 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SgcdP82347 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SgcdP82347 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SgcdP82347 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms