Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nucb2P81117 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nucb2P81117 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nucb2P81117 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nucb2P81117 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nucb2P81117 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nucb2P81117 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nucb2P81117 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nucb2P81117 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nucb2P81117 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nucb2P81117 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nucb2P81117 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nucb2P81117 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nucb2P81117 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Nucb2P81117 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nucb2P81117 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nucb2P81117 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nucb2P81117 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nucb2P81117 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nucb2P81117 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nucb2P81117 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nucb2P81117 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nucb2P81117 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nucb2P81117 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nucb2P81117 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nucb2P81117 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nucb2P81117 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nucb2P81117 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nucb2P81117 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nucb2P81117 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nucb2P81117 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nucb2P81117 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nucb2P81117 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nucb2P81117 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nucb2P81117 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nucb2P81117 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nucb2P81117 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nucb2P81117 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nucb2P81117 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nucb2P81117 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nucb2P81117 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nucb2P81117 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nucb2P81117 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nucb2P81117 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nucb2P81117 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nucb2P81117 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nucb2P81117 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nucb2P81117 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nucb2P81117 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nucb2P81117 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nucb2P81117 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nucb2P81117 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nucb2P81117 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nucb2P81117 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nucb2P81117 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nucb2P81117 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nucb2P81117 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nucb2P81117 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nucb2P81117 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nucb2P81117 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nucb2P81117 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nucb2P81117 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nucb2P81117 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nucb2P81117 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nucb2P81117 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nucb2P81117 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nucb2P81117 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nucb2P81117 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nucb2P81117 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nucb2P81117 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nucb2P81117 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nucb2P81117 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nucb2P81117 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nucb2P81117 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nucb2P81117 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nucb2P81117 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nucb2P81117 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nucb2P81117 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nucb2P81117 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nucb2P81117 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nucb2P81117 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nucb2P81117 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nucb2P81117 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nucb2P81117 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nucb2P81117 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nucb2P81117 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Nucb2P81117 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nucb2P81117 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nucb2P81117 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200 ms