Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shox2P70390 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shox2P70390 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Shox2P70390 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shox2P70390 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shox2P70390 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shox2P70390 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Shox2P70390 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shox2P70390 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shox2P70390 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shox2P70390 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shox2P70390 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shox2P70390 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shox2P70390 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shox2P70390 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shox2P70390 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shox2P70390 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shox2P70390 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shox2P70390 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shox2P70390 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shox2P70390 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shox2P70390 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shox2P70390 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shox2P70390 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shox2P70390 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shox2P70390 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shox2P70390 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shox2P70390 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Shox2P70390 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shox2P70390 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shox2P70390 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Shox2P70390 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shox2P70390 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shox2P70390 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shox2P70390 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shox2P70390 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shox2P70390 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shox2P70390 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shox2P70390 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shox2P70390 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shox2P70390 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shox2P70390 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shox2P70390 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shox2P70390 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shox2P70390 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shox2P70390 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shox2P70390 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shox2P70390 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shox2P70390 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shox2P70390 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Shox2P70390 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shox2P70390 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shox2P70390 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shox2P70390 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shox2P70390 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shox2P70390 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Shox2P70390 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Shox2P70390 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Shox2P70390 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Shox2P70390 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shox2P70390 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shox2P70390 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shox2P70390 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Shox2P70390 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Shox2P70390 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Shox2P70390 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Shox2P70390 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Shox2P70390 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shox2P70390 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Shox2P70390 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Shox2P70390 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Shox2P70390 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shox2P70390 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shox2P70390 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shox2P70390 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shox2P70390 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shox2P70390 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shox2P70390 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shox2P70390 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shox2P70390 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shox2P70390 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shox2P70390 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shox2P70390 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shox2P70390 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shox2P70390 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shox2P70390 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shox2P70390 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shox2P70390 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shox2P70390 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shox2P70390 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shox2P70390 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shox2P70390 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shox2P70390 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shox2P70390 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shox2P70390 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Shox2P70390 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shox2P70390 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shox2P70390 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shox2P70390 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shox2P70390 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms