Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Csnk2bP67871 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Csnk2bP67871 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csnk2bP67871 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csnk2bP67871 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csnk2bP67871 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csnk2bP67871 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csnk2bP67871 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csnk2bP67871 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csnk2bP67871 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csnk2bP67871 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csnk2bP67871 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csnk2bP67871 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csnk2bP67871 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csnk2bP67871 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csnk2bP67871 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csnk2bP67871 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csnk2bP67871 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csnk2bP67871 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csnk2bP67871 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csnk2bP67871 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csnk2bP67871 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Csnk2bP67871 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csnk2bP67871 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csnk2bP67871 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csnk2bP67871 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csnk2bP67871 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csnk2bP67871 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csnk2bP67871 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Csnk2bP67871 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csnk2bP67871 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csnk2bP67871 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csnk2bP67871 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csnk2bP67871 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Csnk2bP67871 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csnk2bP67871 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csnk2bP67871 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csnk2bP67871 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csnk2bP67871 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csnk2bP67871 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csnk2bP67871 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csnk2bP67871 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csnk2bP67871 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csnk2bP67871 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csnk2bP67871 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csnk2bP67871 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csnk2bP67871 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csnk2bP67871 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csnk2bP67871 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csnk2bP67871 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csnk2bP67871 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csnk2bP67871 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csnk2bP67871 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csnk2bP67871 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csnk2bP67871 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csnk2bP67871 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csnk2bP67871 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csnk2bP67871 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csnk2bP67871 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csnk2bP67871 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csnk2bP67871 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csnk2bP67871 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Csnk2bP67871 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csnk2bP67871 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csnk2bP67871 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Csnk2bP67871 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms