Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sumo1P63166 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sumo1P63166 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sumo1P63166 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sumo1P63166 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sumo1P63166 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sumo1P63166 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sumo1P63166 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sumo1P63166 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sumo1P63166 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sumo1P63166 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sumo1P63166 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sumo1P63166 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sumo1P63166 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sumo1P63166 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sumo1P63166 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sumo1P63166 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sumo1P63166 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sumo1P63166 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sumo1P63166 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sumo1P63166 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sumo1P63166 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sumo1P63166 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sumo1P63166 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sumo1P63166 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms