Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp3P63024 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp3P63024 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp3P63024 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp3P63024 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp3P63024 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp3P63024 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp3P63024 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp3P63024 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp3P63024 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp3P63024 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp3P63024 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp3P63024 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Vamp3P63024 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp3P63024 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp3P63024 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp3P63024 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp3P63024 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vamp3P63024 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Vamp3P63024 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp3P63024 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp3P63024 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vamp3P63024 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vamp3P63024 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vamp3P63024 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp3P63024 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp3P63024 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp3P63024 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp3P63024 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp3P63024 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vamp3P63024 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vamp3P63024 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp3P63024 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms