Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps27aP62983 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps27aP62983 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps27aP62983 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps27aP62983 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps27aP62983 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps27aP62983 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps27aP62983 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps27aP62983 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps27aP62983 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps27aP62983 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps27aP62983 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps27aP62983 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps27aP62983 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps27aP62983 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps27aP62983 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps27aP62983 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps27aP62983 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps27aP62983 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps27aP62983 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps27aP62983 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps27aP62983 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps27aP62983 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps27aP62983 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps27aP62983 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rps27aP62983 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps27aP62983 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps27aP62983 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps27aP62983 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps27aP62983 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps27aP62983 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps27aP62983 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps27aP62983 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps27aP62983 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps27aP62983 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps27aP62983 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps27aP62983 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps27aP62983 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps27aP62983 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps27aP62983 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps27aP62983 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps27aP62983 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps27aP62983 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps27aP62983 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps27aP62983 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps27aP62983 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps27aP62983 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps27aP62983 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms