Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps29P62274 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps29P62274 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps29P62274 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps29P62274 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps29P62274 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps29P62274 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps29P62274 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps29P62274 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps29P62274 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps29P62274 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps29P62274 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps29P62274 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps29P62274 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps29P62274 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps29P62274 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps29P62274 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps29P62274 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps29P62274 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps29P62274 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps29P62274 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps29P62274 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps29P62274 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps29P62274 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps29P62274 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps29P62274 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps29P62274 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps29P62274 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps29P62274 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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