Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d1P61080 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2d1P61080 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2d1P61080 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2d1P61080 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2d1P61080 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2d1P61080 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2d1P61080 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2d1P61080 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2d1P61080 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2d1P61080 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2d1P61080 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d1P61080 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d1P61080 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d1P61080 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2d1P61080 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2d1P61080 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2d1P61080 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d1P61080 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d1P61080 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d1P61080 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2d1P61080 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d1P61080 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d1P61080 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2d1P61080 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2d1P61080 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2d1P61080 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2d1P61080 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2d1P61080 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2d1P61080 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d1P61080 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2d1P61080 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d1P61080 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d1P61080 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d1P61080 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d1P61080 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d1P61080 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d1P61080 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d1P61080 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2d1P61080 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2d1P61080 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2d1P61080 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2d1P61080 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms