Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ActbP60710 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ActbP60710 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ActbP60710 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ActbP60710 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ActbP60710 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ActbP60710 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ActbP60710 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ActbP60710 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ActbP60710 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ActbP60710 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ActbP60710 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ActbP60710 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ActbP60710 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ActbP60710 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ActbP60710 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ActbP60710 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ActbP60710 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ActbP60710 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ActbP60710 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ActbP60710 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ActbP60710 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ActbP60710 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ActbP60710 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ActbP60710 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ActbP60710 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ActbP60710 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ActbP60710 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ActbP60710 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ActbP60710 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ActbP60710 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ActbP60710 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ActbP60710 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ActbP60710 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ActbP60710 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ActbP60710 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ActbP60710 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ActbP60710 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ActbP60710 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ActbP60710 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ActbP60710 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ActbP60710 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ActbP60710 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ActbP60710 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ActbP60710 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ActbP60710 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ActbP60710 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ActbP60710 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ActbP60710 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ActbP60710 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ActbP60710 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ActbP60710 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ActbP60710 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ActbP60710 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ActbP60710 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ActbP60710 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ActbP60710 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ActbP60710 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ActbP60710 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ActbP60710 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ActbP60710 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ActbP60710 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ActbP60710 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ActbP60710 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ActbP60710 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ActbP60710 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ActbP60710 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ActbP60710 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ActbP60710 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ActbP60710 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ActbP60710 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ActbP60710 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ActbP60710 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ActbP60710 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ActbP60710 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ActbP60710 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ActbP60710 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ActbP60710 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ActbP60710 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ActbP60710 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ActbP60710 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ActbP60710 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ActbP60710 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ActbP60710 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ActbP60710 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ActbP60710 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ActbP60710 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ActbP60710 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ActbP60710 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ActbP60710 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ActbP60710 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ActbP60710 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ActbP60710 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ActbP60710 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ActbP60710 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ActbP60710 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ActbP60710 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ActbP60710 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ActbP60710 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ActbP60710 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms