Protein–RNA interactions for Protein: P59672

Anks1a, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1aP59672 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Anks1aP59672 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Anks1aP59672 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Anks1aP59672 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Anks1aP59672 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Anks1aP59672 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Anks1aP59672 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Anks1aP59672 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Anks1aP59672 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Anks1aP59672 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Anks1aP59672 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Anks1aP59672 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Anks1aP59672 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Anks1aP59672 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Anks1aP59672 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Anks1aP59672 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Anks1aP59672 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Anks1aP59672 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Anks1aP59672 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 353.5 ms