Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tpm1P58771 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tpm1P58771 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tpm1P58771 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tpm1P58771 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tpm1P58771 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tpm1P58771 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tpm1P58771 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tpm1P58771 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tpm1P58771 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tpm1P58771 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tpm1P58771 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tpm1P58771 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tpm1P58771 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tpm1P58771 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tpm1P58771 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tpm1P58771 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tpm1P58771 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tpm1P58771 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpm1P58771 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpm1P58771 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tpm1P58771 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tpm1P58771 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tpm1P58771 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tpm1P58771 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tpm1P58771 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tpm1P58771 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tpm1P58771 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tpm1P58771 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tpm1P58771 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tpm1P58771 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tpm1P58771 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tpm1P58771 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tpm1P58771 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tpm1P58771 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm1P58771 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm1P58771 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm1P58771 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm1P58771 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tpm1P58771 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tpm1P58771 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tpm1P58771 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpm1P58771 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpm1P58771 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Tpm1P58771 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpm1P58771 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpm1P58771 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tpm1P58771 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tpm1P58771 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tpm1P58771 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tpm1P58771 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tpm1P58771 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tpm1P58771 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tpm1P58771 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpm1P58771 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpm1P58771 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tpm1P58771 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tpm1P58771 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpm1P58771 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpm1P58771 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tpm1P58771 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tpm1P58771 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tpm1P58771 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tpm1P58771 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm1P58771 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm1P58771 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm1P58771 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tpm1P58771 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tpm1P58771 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tpm1P58771 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tpm1P58771 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tpm1P58771 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm1P58771 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm1P58771 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tpm1P58771 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tpm1P58771 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpm1P58771 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tpm1P58771 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tpm1P58771 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tpm1P58771 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpm1P58771 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpm1P58771 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpm1P58771 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpm1P58771 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Tpm1P58771 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tpm1P58771 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm1P58771 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpm1P58771 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tpm1P58771 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms