Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P58686 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P58686 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P58686 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P58686 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P58686 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P58686 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P58686 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P58686 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P58686 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P58686 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P58686 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P58686 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22■■□□□ 1.11
P58686 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P58686 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P58686 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P58686 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P58686 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P58686 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P58686 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P58686 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P58686 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P58686 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P58686 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P58686 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P58686 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P58686 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P58686 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P58686 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P58686 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P58686 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P58686 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P58686 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P58686 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P58686 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P58686 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P58686 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P58686 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P58686 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P58686 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P58686 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P58686 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P58686 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P58686 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P58686 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P58686 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P58686 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
P58686 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P58686 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
P58686 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P58686 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P58686 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P58686 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P58686 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P58686 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P58686 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P58686 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P58686 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P58686 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P58686 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P58686 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P58686 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P58686 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P58686 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P58686 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P58686 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P58686 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P58686 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P58686 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P58686 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P58686 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P58686 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P58686 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P58686 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P58686 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P58686 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P58686 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P58686 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P58686 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P58686 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P58686 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P58686 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P58686 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
P58686 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
P58686 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P58686 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P58686 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P58686 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P58686 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P58686 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P58686 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P58686 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P58686 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P58686 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P58686 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P58686 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P58686 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P58686 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P58686 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P58686 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms