Protein–RNA interactions for Protein: P58390

Kcnn2, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn2P58390 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnn2P58390 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnn2P58390 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnn2P58390 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kcnn2P58390 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kcnn2P58390 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kcnn2P58390 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Kcnn2P58390 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kcnn2P58390 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kcnn2P58390 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kcnn2P58390 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kcnn2P58390 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kcnn2P58390 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kcnn2P58390 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kcnn2P58390 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kcnn2P58390 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnn2P58390 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kcnn2P58390 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kcnn2P58390 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kcnn2P58390 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kcnn2P58390 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kcnn2P58390 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kcnn2P58390 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kcnn2P58390 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kcnn2P58390 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kcnn2P58390 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnn2P58390 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnn2P58390 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kcnn2P58390 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kcnn2P58390 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kcnn2P58390 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kcnn2P58390 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kcnn2P58390 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kcnn2P58390 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kcnn2P58390 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnn2P58390 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnn2P58390 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kcnn2P58390 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kcnn2P58390 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnn2P58390 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnn2P58390 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kcnn2P58390 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kcnn2P58390 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kcnn2P58390 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kcnn2P58390 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcnn2P58390 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnn2P58390 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcnn2P58390 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnn2P58390 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnn2P58390 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcnn2P58390 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcnn2P58390 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcnn2P58390 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcnn2P58390 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcnn2P58390 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcnn2P58390 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcnn2P58390 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcnn2P58390 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcnn2P58390 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kcnn2P58390 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kcnn2P58390 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcnn2P58390 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcnn2P58390 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kcnn2P58390 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kcnn2P58390 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kcnn2P58390 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kcnn2P58390 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kcnn2P58390 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Kcnn2P58390 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kcnn2P58390 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnn2P58390 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnn2P58390 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnn2P58390 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnn2P58390 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnn2P58390 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnn2P58390 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnn2P58390 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnn2P58390 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnn2P58390 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcnn2P58390 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcnn2P58390 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcnn2P58390 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcnn2P58390 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnn2P58390 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnn2P58390 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnn2P58390 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Kcnn2P58390 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnn2P58390 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnn2P58390 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnn2P58390 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kcnn2P58390 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnn2P58390 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnn2P58390 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnn2P58390 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnn2P58390 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcnn2P58390 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcnn2P58390 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcnn2P58390 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcnn2P58390 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcnn2P58390 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms