Protein–RNA interactions for Protein: P56404

Aqp8, Aquaporin-8, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp8P56404 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Aqp8P56404 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Aqp8P56404 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aqp8P56404 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aqp8P56404 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aqp8P56404 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aqp8P56404 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Aqp8P56404 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aqp8P56404 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aqp8P56404 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aqp8P56404 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aqp8P56404 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aqp8P56404 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aqp8P56404 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aqp8P56404 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aqp8P56404 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aqp8P56404 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aqp8P56404 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aqp8P56404 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aqp8P56404 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aqp8P56404 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Aqp8P56404 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aqp8P56404 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Aqp8P56404 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aqp8P56404 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aqp8P56404 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aqp8P56404 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aqp8P56404 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aqp8P56404 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aqp8P56404 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aqp8P56404 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aqp8P56404 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aqp8P56404 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aqp8P56404 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aqp8P56404 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aqp8P56404 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aqp8P56404 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aqp8P56404 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Aqp8P56404 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aqp8P56404 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aqp8P56404 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aqp8P56404 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aqp8P56404 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aqp8P56404 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aqp8P56404 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Aqp8P56404 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aqp8P56404 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aqp8P56404 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aqp8P56404 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aqp8P56404 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aqp8P56404 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aqp8P56404 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aqp8P56404 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aqp8P56404 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aqp8P56404 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aqp8P56404 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aqp8P56404 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aqp8P56404 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Aqp8P56404 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Aqp8P56404 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aqp8P56404 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aqp8P56404 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aqp8P56404 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aqp8P56404 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aqp8P56404 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms