Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pex2P55098 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pex2P55098 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pex2P55098 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pex2P55098 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pex2P55098 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pex2P55098 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pex2P55098 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pex2P55098 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pex2P55098 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pex2P55098 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pex2P55098 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pex2P55098 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pex2P55098 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pex2P55098 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pex2P55098 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pex2P55098 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pex2P55098 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pex2P55098 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pex2P55098 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pex2P55098 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pex2P55098 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pex2P55098 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pex2P55098 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pex2P55098 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pex2P55098 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pex2P55098 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pex2P55098 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pex2P55098 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pex2P55098 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pex2P55098 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pex2P55098 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pex2P55098 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pex2P55098 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pex2P55098 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pex2P55098 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pex2P55098 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pex2P55098 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pex2P55098 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pex2P55098 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pex2P55098 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pex2P55098 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pex2P55098 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pex2P55098 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pex2P55098 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pex2P55098 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pex2P55098 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pex2P55098 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pex2P55098 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pex2P55098 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pex2P55098 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pex2P55098 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pex2P55098 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pex2P55098 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pex2P55098 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pex2P55098 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pex2P55098 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pex2P55098 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pex2P55098 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pex2P55098 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pex2P55098 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pex2P55098 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pex2P55098 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pex2P55098 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pex2P55098 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pex2P55098 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pex2P55098 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pex2P55098 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pex2P55098 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pex2P55098 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pex2P55098 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pex2P55098 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pex2P55098 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex2P55098 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex2P55098 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pex2P55098 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pex2P55098 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pex2P55098 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pex2P55098 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pex2P55098 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pex2P55098 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pex2P55098 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pex2P55098 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pex2P55098 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pex2P55098 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms