Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PctpP53808 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PctpP53808 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PctpP53808 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PctpP53808 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PctpP53808 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PctpP53808 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PctpP53808 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PctpP53808 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PctpP53808 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PctpP53808 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PctpP53808 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PctpP53808 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PctpP53808 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PctpP53808 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PctpP53808 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PctpP53808 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PctpP53808 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PctpP53808 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PctpP53808 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PctpP53808 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PctpP53808 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PctpP53808 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PctpP53808 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PctpP53808 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PctpP53808 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PctpP53808 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PctpP53808 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PctpP53808 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PctpP53808 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PctpP53808 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PctpP53808 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PctpP53808 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PctpP53808 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PctpP53808 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PctpP53808 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PctpP53808 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PctpP53808 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PctpP53808 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PctpP53808 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PctpP53808 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PctpP53808 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PctpP53808 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PctpP53808 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PctpP53808 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PctpP53808 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PctpP53808 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PctpP53808 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PctpP53808 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PctpP53808 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PctpP53808 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PctpP53808 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PctpP53808 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PctpP53808 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PctpP53808 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PctpP53808 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PctpP53808 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PctpP53808 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PctpP53808 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PctpP53808 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PctpP53808 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PctpP53808 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PctpP53808 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PctpP53808 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PctpP53808 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PctpP53808 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PctpP53808 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PctpP53808 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PctpP53808 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PctpP53808 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PctpP53808 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PctpP53808 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PctpP53808 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PctpP53808 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PctpP53808 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PctpP53808 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PctpP53808 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PctpP53808 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PctpP53808 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PctpP53808 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PctpP53808 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PctpP53808 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PctpP53808 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PctpP53808 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PctpP53808 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PctpP53808 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PctpP53808 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PctpP53808 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PctpP53808 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PctpP53808 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PctpP53808 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PctpP53808 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PctpP53808 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PctpP53808 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PctpP53808 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PctpP53808 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PctpP53808 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PctpP53808 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PctpP53808 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PctpP53808 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms