Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Efna1P52793 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efna1P52793 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efna1P52793 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efna1P52793 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Efna1P52793 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efna1P52793 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efna1P52793 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efna1P52793 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efna1P52793 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efna1P52793 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efna1P52793 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efna1P52793 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efna1P52793 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efna1P52793 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efna1P52793 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efna1P52793 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efna1P52793 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efna1P52793 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efna1P52793 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Efna1P52793 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efna1P52793 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efna1P52793 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efna1P52793 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efna1P52793 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efna1P52793 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efna1P52793 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efna1P52793 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efna1P52793 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Efna1P52793 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efna1P52793 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efna1P52793 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efna1P52793 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Efna1P52793 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efna1P52793 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efna1P52793 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efna1P52793 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efna1P52793 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efna1P52793 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efna1P52793 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Efna1P52793 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efna1P52793 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efna1P52793 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efna1P52793 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efna1P52793 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efna1P52793 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efna1P52793 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efna1P52793 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efna1P52793 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efna1P52793 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efna1P52793 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efna1P52793 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efna1P52793 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Efna1P52793 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efna1P52793 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna1P52793 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efna1P52793 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna1P52793 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna1P52793 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna1P52793 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna1P52793 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna1P52793 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna1P52793 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna1P52793 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efna1P52793 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna1P52793 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efna1P52793 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna1P52793 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna1P52793 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna1P52793 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna1P52793 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna1P52793 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna1P52793 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efna1P52793 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efna1P52793 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efna1P52793 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efna1P52793 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efna1P52793 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna1P52793 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna1P52793 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna1P52793 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna1P52793 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna1P52793 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efna1P52793 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Efna1P52793 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efna1P52793 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Efna1P52793 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms