Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RoraP51448 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RoraP51448 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RoraP51448 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RoraP51448 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RoraP51448 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RoraP51448 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RoraP51448 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RoraP51448 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RoraP51448 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RoraP51448 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RoraP51448 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RoraP51448 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RoraP51448 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RoraP51448 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RoraP51448 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RoraP51448 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RoraP51448 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RoraP51448 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RoraP51448 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RoraP51448 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RoraP51448 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RoraP51448 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RoraP51448 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RoraP51448 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RoraP51448 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RoraP51448 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RoraP51448 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RoraP51448 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RoraP51448 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RoraP51448 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RoraP51448 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RoraP51448 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RoraP51448 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RoraP51448 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RoraP51448 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RoraP51448 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RoraP51448 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RoraP51448 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RoraP51448 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RoraP51448 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RoraP51448 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RoraP51448 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RoraP51448 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RoraP51448 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RoraP51448 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RoraP51448 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RoraP51448 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RoraP51448 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RoraP51448 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RoraP51448 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RoraP51448 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RoraP51448 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RoraP51448 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RoraP51448 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RoraP51448 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RoraP51448 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RoraP51448 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RoraP51448 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RoraP51448 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RoraP51448 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RoraP51448 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RoraP51448 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RoraP51448 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RoraP51448 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RoraP51448 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RoraP51448 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RoraP51448 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RoraP51448 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RoraP51448 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RoraP51448 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RoraP51448 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RoraP51448 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RoraP51448 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RoraP51448 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RoraP51448 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RoraP51448 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RoraP51448 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RoraP51448 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RoraP51448 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RoraP51448 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RoraP51448 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RoraP51448 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RoraP51448 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RoraP51448 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RoraP51448 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RoraP51448 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RoraP51448 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RoraP51448 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RoraP51448 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RoraP51448 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RoraP51448 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RoraP51448 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RoraP51448 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RoraP51448 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RoraP51448 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RoraP51448 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RoraP51448 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RoraP51448 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RoraP51448 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms