Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa10P50708 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa10P50708 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa10P50708 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa10P50708 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa10P50708 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa10P50708 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa10P50708 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa10P50708 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa10P50708 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa10P50708 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa10P50708 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa10P50708 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa10P50708 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa10P50708 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa10P50708 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa10P50708 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa10P50708 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa10P50708 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa10P50708 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa10P50708 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa10P50708 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa10P50708 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa10P50708 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa10P50708 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa10P50708 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa10P50708 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa10P50708 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa10P50708 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa10P50708 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa10P50708 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa10P50708 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa10P50708 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa10P50708 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa10P50708 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa10P50708 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa10P50708 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa10P50708 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa10P50708 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa10P50708 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa10P50708 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Defa10P50708 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa10P50708 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa10P50708 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa10P50708 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa10P50708 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa10P50708 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms