Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdkn1cP49919 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdkn1cP49919 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdkn1cP49919 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdkn1cP49919 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdkn1cP49919 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdkn1cP49919 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdkn1cP49919 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdkn1cP49919 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdkn1cP49919 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdkn1cP49919 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdkn1cP49919 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdkn1cP49919 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdkn1cP49919 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdkn1cP49919 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdkn1cP49919 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdkn1cP49919 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdkn1cP49919 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdkn1cP49919 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdkn1cP49919 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdkn1cP49919 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdkn1cP49919 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdkn1cP49919 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdkn1cP49919 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdkn1cP49919 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdkn1cP49919 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdkn1cP49919 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdkn1cP49919 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdkn1cP49919 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdkn1cP49919 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdkn1cP49919 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdkn1cP49919 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdkn1cP49919 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdkn1cP49919 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdkn1cP49919 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cdkn1cP49919 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdkn1cP49919 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdkn1cP49919 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdkn1cP49919 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdkn1cP49919 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdkn1cP49919 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdkn1cP49919 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdkn1cP49919 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdkn1cP49919 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdkn1cP49919 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdkn1cP49919 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdkn1cP49919 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdkn1cP49919 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdkn1cP49919 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdkn1cP49919 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdkn1cP49919 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdkn1cP49919 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdkn1cP49919 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdkn1cP49919 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdkn1cP49919 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdkn1cP49919 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdkn1cP49919 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdkn1cP49919 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdkn1cP49919 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdkn1cP49919 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdkn1cP49919 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdkn1cP49919 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdkn1cP49919 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdkn1cP49919 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdkn1cP49919 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdkn1cP49919 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdkn1cP49919 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdkn1cP49919 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdkn1cP49919 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdkn1cP49919 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdkn1cP49919 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdkn1cP49919 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdkn1cP49919 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdkn1cP49919 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdkn1cP49919 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdkn1cP49919 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdkn1cP49919 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdkn1cP49919 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdkn1cP49919 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdkn1cP49919 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdkn1cP49919 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdkn1cP49919 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cdkn1cP49919 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdkn1cP49919 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdkn1cP49919 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdkn1cP49919 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdkn1cP49919 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdkn1cP49919 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms