Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Tmod1P49813 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmod1P49813 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmod1P49813 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmod1P49813 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmod1P49813 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tmod1P49813 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmod1P49813 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmod1P49813 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmod1P49813 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmod1P49813 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tmod1P49813 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmod1P49813 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmod1P49813 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmod1P49813 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmod1P49813 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmod1P49813 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmod1P49813 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tmod1P49813 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tmod1P49813 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmod1P49813 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmod1P49813 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmod1P49813 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmod1P49813 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmod1P49813 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmod1P49813 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tmod1P49813 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Tmod1P49813 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tmod1P49813 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmod1P49813 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmod1P49813 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmod1P49813 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tmod1P49813 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmod1P49813 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmod1P49813 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmod1P49813 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmod1P49813 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmod1P49813 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tmod1P49813 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tmod1P49813 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tmod1P49813 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmod1P49813 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmod1P49813 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmod1P49813 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmod1P49813 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tmod1P49813 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmod1P49813 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmod1P49813 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmod1P49813 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmod1P49813 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmod1P49813 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmod1P49813 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmod1P49813 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmod1P49813 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmod1P49813 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmod1P49813 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmod1P49813 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmod1P49813 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tmod1P49813 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmod1P49813 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmod1P49813 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmod1P49813 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmod1P49813 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmod1P49813 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmod1P49813 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmod1P49813 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmod1P49813 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmod1P49813 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmod1P49813 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmod1P49813 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmod1P49813 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmod1P49813 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmod1P49813 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmod1P49813 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmod1P49813 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmod1P49813 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmod1P49813 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmod1P49813 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmod1P49813 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmod1P49813 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmod1P49813 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tmod1P49813 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmod1P49813 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmod1P49813 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmod1P49813 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmod1P49813 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmod1P49813 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmod1P49813 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmod1P49813 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms