Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prox1P48437 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prox1P48437 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prox1P48437 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prox1P48437 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prox1P48437 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prox1P48437 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prox1P48437 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prox1P48437 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prox1P48437 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prox1P48437 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prox1P48437 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prox1P48437 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prox1P48437 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prox1P48437 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prox1P48437 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prox1P48437 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prox1P48437 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prox1P48437 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prox1P48437 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prox1P48437 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prox1P48437 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prox1P48437 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prox1P48437 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prox1P48437 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prox1P48437 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prox1P48437 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prox1P48437 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prox1P48437 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prox1P48437 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prox1P48437 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prox1P48437 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prox1P48437 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prox1P48437 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prox1P48437 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prox1P48437 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prox1P48437 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prox1P48437 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prox1P48437 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prox1P48437 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prox1P48437 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prox1P48437 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prox1P48437 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prox1P48437 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prox1P48437 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prox1P48437 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prox1P48437 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prox1P48437 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prox1P48437 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prox1P48437 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prox1P48437 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prox1P48437 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prox1P48437 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prox1P48437 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prox1P48437 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prox1P48437 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prox1P48437 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prox1P48437 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prox1P48437 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prox1P48437 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prox1P48437 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prox1P48437 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prox1P48437 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prox1P48437 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prox1P48437 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prox1P48437 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prox1P48437 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prox1P48437 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prox1P48437 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prox1P48437 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prox1P48437 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prox1P48437 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prox1P48437 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prox1P48437 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prox1P48437 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prox1P48437 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prox1P48437 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prox1P48437 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prox1P48437 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prox1P48437 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prox1P48437 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prox1P48437 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prox1P48437 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prox1P48437 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prox1P48437 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prox1P48437 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prox1P48437 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prox1P48437 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prox1P48437 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prox1P48437 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prox1P48437 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prox1P48437 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prox1P48437 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prox1P48437 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Prox1P48437 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prox1P48437 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prox1P48437 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prox1P48437 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prox1P48437 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prox1P48437 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms