Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox2P48432 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox2P48432 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox2P48432 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox2P48432 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox2P48432 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox2P48432 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox2P48432 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox2P48432 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox2P48432 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox2P48432 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox2P48432 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox2P48432 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox2P48432 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox2P48432 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox2P48432 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox2P48432 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox2P48432 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox2P48432 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox2P48432 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox2P48432 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox2P48432 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox2P48432 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox2P48432 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox2P48432 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox2P48432 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox2P48432 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox2P48432 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox2P48432 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox2P48432 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox2P48432 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox2P48432 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sox2P48432 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox2P48432 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox2P48432 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox2P48432 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox2P48432 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox2P48432 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox2P48432 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox2P48432 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox2P48432 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox2P48432 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox2P48432 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox2P48432 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox2P48432 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox2P48432 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox2P48432 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox2P48432 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox2P48432 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox2P48432 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox2P48432 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox2P48432 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox2P48432 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox2P48432 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox2P48432 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox2P48432 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox2P48432 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox2P48432 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox2P48432 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox2P48432 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox2P48432 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox2P48432 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sox2P48432 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox2P48432 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox2P48432 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox2P48432 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox2P48432 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox2P48432 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox2P48432 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox2P48432 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox2P48432 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox2P48432 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox2P48432 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox2P48432 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox2P48432 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox2P48432 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox2P48432 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox2P48432 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox2P48432 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox2P48432 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox2P48432 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox2P48432 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox2P48432 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox2P48432 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox2P48432 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox2P48432 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox2P48432 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox2P48432 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox2P48432 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox2P48432 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox2P48432 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox2P48432 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox2P48432 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox2P48432 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox2P48432 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox2P48432 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox2P48432 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox2P48432 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox2P48432 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox2P48432 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms