Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Edn3P48299 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Edn3P48299 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Edn3P48299 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Edn3P48299 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Edn3P48299 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Edn3P48299 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Edn3P48299 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edn3P48299 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edn3P48299 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edn3P48299 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edn3P48299 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edn3P48299 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edn3P48299 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edn3P48299 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edn3P48299 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Edn3P48299 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edn3P48299 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edn3P48299 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edn3P48299 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Edn3P48299 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edn3P48299 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edn3P48299 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edn3P48299 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edn3P48299 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edn3P48299 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edn3P48299 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edn3P48299 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edn3P48299 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edn3P48299 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edn3P48299 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edn3P48299 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edn3P48299 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edn3P48299 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edn3P48299 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edn3P48299 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edn3P48299 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edn3P48299 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edn3P48299 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edn3P48299 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edn3P48299 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edn3P48299 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edn3P48299 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edn3P48299 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edn3P48299 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edn3P48299 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Edn3P48299 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edn3P48299 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edn3P48299 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edn3P48299 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edn3P48299 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edn3P48299 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edn3P48299 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edn3P48299 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Edn3P48299 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edn3P48299 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edn3P48299 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edn3P48299 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edn3P48299 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edn3P48299 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edn3P48299 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edn3P48299 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edn3P48299 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edn3P48299 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Edn3P48299 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edn3P48299 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edn3P48299 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edn3P48299 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edn3P48299 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Edn3P48299 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edn3P48299 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edn3P48299 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edn3P48299 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edn3P48299 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edn3P48299 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edn3P48299 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edn3P48299 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edn3P48299 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edn3P48299 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edn3P48299 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edn3P48299 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edn3P48299 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Edn3P48299 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edn3P48299 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edn3P48299 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edn3P48299 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edn3P48299 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edn3P48299 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edn3P48299 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Edn3P48299 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Edn3P48299 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edn3P48299 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Edn3P48299 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edn3P48299 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Edn3P48299 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edn3P48299 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edn3P48299 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edn3P48299 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Edn3P48299 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Edn3P48299 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms