Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VdrP48281 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VdrP48281 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VdrP48281 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VdrP48281 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VdrP48281 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VdrP48281 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VdrP48281 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VdrP48281 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VdrP48281 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VdrP48281 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VdrP48281 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VdrP48281 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VdrP48281 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VdrP48281 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VdrP48281 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VdrP48281 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VdrP48281 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VdrP48281 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VdrP48281 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VdrP48281 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VdrP48281 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VdrP48281 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VdrP48281 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VdrP48281 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VdrP48281 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VdrP48281 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VdrP48281 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VdrP48281 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VdrP48281 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VdrP48281 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VdrP48281 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VdrP48281 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VdrP48281 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VdrP48281 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VdrP48281 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VdrP48281 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VdrP48281 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VdrP48281 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VdrP48281 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VdrP48281 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VdrP48281 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VdrP48281 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VdrP48281 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VdrP48281 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VdrP48281 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VdrP48281 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VdrP48281 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VdrP48281 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VdrP48281 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VdrP48281 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VdrP48281 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VdrP48281 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VdrP48281 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VdrP48281 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VdrP48281 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VdrP48281 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VdrP48281 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VdrP48281 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VdrP48281 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VdrP48281 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VdrP48281 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VdrP48281 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VdrP48281 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VdrP48281 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VdrP48281 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VdrP48281 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VdrP48281 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VdrP48281 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VdrP48281 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VdrP48281 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VdrP48281 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VdrP48281 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VdrP48281 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VdrP48281 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VdrP48281 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VdrP48281 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VdrP48281 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VdrP48281 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VdrP48281 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VdrP48281 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VdrP48281 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VdrP48281 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VdrP48281 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VdrP48281 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VdrP48281 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VdrP48281 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VdrP48281 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VdrP48281 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VdrP48281 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VdrP48281 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VdrP48281 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VdrP48281 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VdrP48281 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VdrP48281 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VdrP48281 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VdrP48281 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VdrP48281 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VdrP48281 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VdrP48281 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms