Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Epb41P48193 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epb41P48193 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epb41P48193 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epb41P48193 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epb41P48193 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epb41P48193 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epb41P48193 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epb41P48193 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Epb41P48193 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Epb41P48193 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Epb41P48193 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epb41P48193 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epb41P48193 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Epb41P48193 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Epb41P48193 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epb41P48193 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Epb41P48193 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Epb41P48193 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41P48193 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41P48193 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41P48193 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41P48193 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41P48193 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41P48193 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41P48193 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41P48193 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41P48193 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epb41P48193 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epb41P48193 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epb41P48193 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb41P48193 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb41P48193 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41P48193 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41P48193 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41P48193 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41P48193 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epb41P48193 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epb41P48193 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb41P48193 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41P48193 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41P48193 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb41P48193 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb41P48193 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb41P48193 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb41P48193 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epb41P48193 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Epb41P48193 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Epb41P48193 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Epb41P48193 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Epb41P48193 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Epb41P48193 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Epb41P48193 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Epb41P48193 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Epb41P48193 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Epb41P48193 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epb41P48193 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epb41P48193 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epb41P48193 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epb41P48193 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epb41P48193 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epb41P48193 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epb41P48193 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epb41P48193 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Epb41P48193 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Epb41P48193 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Epb41P48193 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Epb41P48193 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Epb41P48193 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Epb41P48193 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Epb41P48193 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Epb41P48193 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Epb41P48193 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epb41P48193 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epb41P48193 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epb41P48193 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epb41P48193 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epb41P48193 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epb41P48193 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epb41P48193 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Epb41P48193 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Epb41P48193 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Epb41P48193 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Epb41P48193 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Epb41P48193 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Epb41P48193 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Epb41P48193 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Epb41P48193 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Epb41P48193 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Epb41P48193 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Epb41P48193 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Epb41P48193 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Epb41P48193 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Epb41P48193 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Epb41P48193 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Epb41P48193 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Epb41P48193 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Epb41P48193 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Epb41P48193 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Epb41P48193 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms