Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TgfaP48030 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TgfaP48030 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TgfaP48030 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TgfaP48030 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TgfaP48030 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TgfaP48030 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TgfaP48030 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TgfaP48030 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TgfaP48030 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TgfaP48030 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TgfaP48030 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TgfaP48030 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TgfaP48030 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TgfaP48030 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TgfaP48030 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TgfaP48030 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TgfaP48030 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TgfaP48030 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TgfaP48030 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TgfaP48030 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TgfaP48030 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgfaP48030 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgfaP48030 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgfaP48030 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TgfaP48030 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TgfaP48030 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TgfaP48030 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TgfaP48030 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TgfaP48030 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TgfaP48030 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TgfaP48030 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TgfaP48030 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TgfaP48030 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TgfaP48030 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TgfaP48030 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TgfaP48030 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TgfaP48030 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TgfaP48030 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TgfaP48030 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TgfaP48030 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TgfaP48030 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TgfaP48030 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TgfaP48030 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgfaP48030 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgfaP48030 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TgfaP48030 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TgfaP48030 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TgfaP48030 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgfaP48030 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgfaP48030 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgfaP48030 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TgfaP48030 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TgfaP48030 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TgfaP48030 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TgfaP48030 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TgfaP48030 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TgfaP48030 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TgfaP48030 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TgfaP48030 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TgfaP48030 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TgfaP48030 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TgfaP48030 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TgfaP48030 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TgfaP48030 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TgfaP48030 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TgfaP48030 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TgfaP48030 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TgfaP48030 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgfaP48030 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgfaP48030 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TgfaP48030 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgfaP48030 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TgfaP48030 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TgfaP48030 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TgfaP48030 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TgfaP48030 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TgfaP48030 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TgfaP48030 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgfaP48030 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgfaP48030 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TgfaP48030 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgfaP48030 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TgfaP48030 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TgfaP48030 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TgfaP48030 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TgfaP48030 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TgfaP48030 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TgfaP48030 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms