Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpl5P47962 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl5P47962 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl5P47962 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl5P47962 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpl5P47962 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpl5P47962 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl5P47962 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl5P47962 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl5P47962 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl5P47962 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl5P47962 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl5P47962 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl5P47962 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl5P47962 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl5P47962 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl5P47962 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl5P47962 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl5P47962 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl5P47962 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl5P47962 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl5P47962 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpl5P47962 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl5P47962 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl5P47962 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl5P47962 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl5P47962 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl5P47962 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl5P47962 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl5P47962 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl5P47962 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl5P47962 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl5P47962 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl5P47962 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl5P47962 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl5P47962 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpl5P47962 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpl5P47962 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl5P47962 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl5P47962 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl5P47962 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl5P47962 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl5P47962 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl5P47962 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl5P47962 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl5P47962 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpl5P47962 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl5P47962 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl5P47962 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl5P47962 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl5P47962 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl5P47962 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl5P47962 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl5P47962 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl5P47962 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rpl5P47962 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl5P47962 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl5P47962 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl5P47962 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl5P47962 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl5P47962 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms