Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl6P47911 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl6P47911 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpl6P47911 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpl6P47911 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpl6P47911 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpl6P47911 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpl6P47911 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl6P47911 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpl6P47911 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpl6P47911 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl6P47911 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl6P47911 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpl6P47911 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl6P47911 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl6P47911 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl6P47911 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl6P47911 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl6P47911 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl6P47911 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl6P47911 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl6P47911 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl6P47911 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl6P47911 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl6P47911 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl6P47911 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl6P47911 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl6P47911 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl6P47911 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl6P47911 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl6P47911 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl6P47911 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl6P47911 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl6P47911 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl6P47911 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl6P47911 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl6P47911 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl6P47911 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl6P47911 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl6P47911 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl6P47911 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl6P47911 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl6P47911 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl6P47911 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl6P47911 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl6P47911 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl6P47911 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl6P47911 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl6P47911 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl6P47911 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl6P47911 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl6P47911 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl6P47911 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl6P47911 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl6P47911 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms