Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd2P46718 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd2P46718 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd2P46718 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pdcd2P46718 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pdcd2P46718 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcd2P46718 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd2P46718 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd2P46718 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd2P46718 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd2P46718 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd2P46718 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd2P46718 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd2P46718 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd2P46718 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd2P46718 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd2P46718 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd2P46718 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd2P46718 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd2P46718 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd2P46718 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcd2P46718 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcd2P46718 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd2P46718 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd2P46718 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd2P46718 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd2P46718 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd2P46718 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd2P46718 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd2P46718 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd2P46718 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd2P46718 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd2P46718 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcd2P46718 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcd2P46718 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd2P46718 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd2P46718 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd2P46718 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd2P46718 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcd2P46718 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd2P46718 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd2P46718 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd2P46718 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd2P46718 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd2P46718 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd2P46718 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd2P46718 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd2P46718 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd2P46718 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd2P46718 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd2P46718 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd2P46718 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd2P46718 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd2P46718 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdcd2P46718 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcd2P46718 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd2P46718 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd2P46718 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd2P46718 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd2P46718 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd2P46718 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd2P46718 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd2P46718 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd2P46718 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd2P46718 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd2P46718 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd2P46718 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd2P46718 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcd2P46718 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcd2P46718 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcd2P46718 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcd2P46718 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcd2P46718 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd2P46718 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcd2P46718 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcd2P46718 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd2P46718 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd2P46718 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd2P46718 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcd2P46718 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdcd2P46718 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcd2P46718 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd2P46718 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd2P46718 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd2P46718 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd2P46718 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd2P46718 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd2P46718 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd2P46718 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcd2P46718 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd2P46718 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd2P46718 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd2P46718 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd2P46718 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd2P46718 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd2P46718 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd2P46718 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd2P46718 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd2P46718 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd2P46718 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms