Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab11bP46638 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11bP46638 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11bP46638 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11bP46638 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11bP46638 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11bP46638 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11bP46638 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11bP46638 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11bP46638 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11bP46638 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11bP46638 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11bP46638 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11bP46638 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11bP46638 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11bP46638 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11bP46638 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11bP46638 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11bP46638 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11bP46638 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11bP46638 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11bP46638 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11bP46638 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11bP46638 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11bP46638 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11bP46638 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11bP46638 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11bP46638 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11bP46638 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11bP46638 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11bP46638 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11bP46638 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11bP46638 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11bP46638 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11bP46638 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11bP46638 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11bP46638 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11bP46638 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11bP46638 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11bP46638 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11bP46638 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11bP46638 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rab11bP46638 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11bP46638 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11bP46638 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11bP46638 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11bP46638 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11bP46638 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11bP46638 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11bP46638 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11bP46638 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11bP46638 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11bP46638 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11bP46638 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11bP46638 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11bP46638 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11bP46638 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11bP46638 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab11bP46638 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab11bP46638 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11bP46638 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11bP46638 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11bP46638 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11bP46638 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11bP46638 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11bP46638 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11bP46638 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11bP46638 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11bP46638 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11bP46638 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab11bP46638 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab11bP46638 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11bP46638 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11bP46638 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11bP46638 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11bP46638 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11bP46638 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11bP46638 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms