Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx2-5P42582 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx2-5P42582 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx2-5P42582 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nkx2-5P42582 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx2-5P42582 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx2-5P42582 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx2-5P42582 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx2-5P42582 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nkx2-5P42582 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nkx2-5P42582 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nkx2-5P42582 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nkx2-5P42582 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx2-5P42582 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx2-5P42582 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nkx2-5P42582 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx2-5P42582 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx2-5P42582 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx2-5P42582 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx2-5P42582 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx2-5P42582 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nkx2-5P42582 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nkx2-5P42582 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx2-5P42582 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx2-5P42582 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nkx2-5P42582 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nkx2-5P42582 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nkx2-5P42582 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx2-5P42582 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx2-5P42582 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nkx2-5P42582 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx2-5P42582 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx2-5P42582 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx2-5P42582 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx2-5P42582 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nkx2-5P42582 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nkx2-5P42582 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx2-5P42582 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nkx2-5P42582 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx2-5P42582 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nkx2-5P42582 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nkx2-5P42582 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nkx2-5P42582 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx2-5P42582 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx2-5P42582 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nkx2-5P42582 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx2-5P42582 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx2-5P42582 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx2-5P42582 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nkx2-5P42582 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx2-5P42582 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-5P42582 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-5P42582 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-5P42582 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx2-5P42582 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx2-5P42582 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx2-5P42582 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx2-5P42582 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx2-5P42582 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx2-5P42582 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx2-5P42582 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx2-5P42582 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nkx2-5P42582 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx2-5P42582 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx2-5P42582 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-5P42582 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-5P42582 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-5P42582 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nkx2-5P42582 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx2-5P42582 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nkx2-5P42582 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx2-5P42582 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx2-5P42582 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx2-5P42582 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nkx2-5P42582 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nkx2-5P42582 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx2-5P42582 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx2-5P42582 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx2-5P42582 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx2-5P42582 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms