Protein–RNA interactions for Protein: P38532

Hsf1, Heat shock factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf1P38532 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hsf1P38532 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hsf1P38532 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsf1P38532 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsf1P38532 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hsf1P38532 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hsf1P38532 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hsf1P38532 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hsf1P38532 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hsf1P38532 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hsf1P38532 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hsf1P38532 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hsf1P38532 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hsf1P38532 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hsf1P38532 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hsf1P38532 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hsf1P38532 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hsf1P38532 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hsf1P38532 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hsf1P38532 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hsf1P38532 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hsf1P38532 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hsf1P38532 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hsf1P38532 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hsf1P38532 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hsf1P38532 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsf1P38532 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsf1P38532 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsf1P38532 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsf1P38532 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hsf1P38532 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hsf1P38532 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hsf1P38532 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hsf1P38532 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hsf1P38532 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hsf1P38532 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hsf1P38532 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hsf1P38532 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hsf1P38532 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hsf1P38532 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hsf1P38532 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hsf1P38532 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsf1P38532 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsf1P38532 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsf1P38532 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsf1P38532 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsf1P38532 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsf1P38532 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hsf1P38532 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hsf1P38532 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hsf1P38532 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hsf1P38532 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hsf1P38532 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hsf1P38532 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hsf1P38532 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hsf1P38532 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hsf1P38532 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hsf1P38532 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hsf1P38532 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hsf1P38532 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hsf1P38532 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms