Protein–RNA interactions for Protein: P35347

Crhr1, Corticotropin-releasing factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crhr1P35347 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crhr1P35347 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crhr1P35347 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Crhr1P35347 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crhr1P35347 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crhr1P35347 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crhr1P35347 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crhr1P35347 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crhr1P35347 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crhr1P35347 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crhr1P35347 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crhr1P35347 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crhr1P35347 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crhr1P35347 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Crhr1P35347 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crhr1P35347 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crhr1P35347 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crhr1P35347 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crhr1P35347 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crhr1P35347 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crhr1P35347 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crhr1P35347 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crhr1P35347 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crhr1P35347 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crhr1P35347 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crhr1P35347 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Crhr1P35347 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Crhr1P35347 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crhr1P35347 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Crhr1P35347 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crhr1P35347 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crhr1P35347 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crhr1P35347 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crhr1P35347 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crhr1P35347 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crhr1P35347 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crhr1P35347 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crhr1P35347 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crhr1P35347 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crhr1P35347 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crhr1P35347 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crhr1P35347 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crhr1P35347 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crhr1P35347 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Crhr1P35347 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crhr1P35347 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crhr1P35347 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crhr1P35347 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crhr1P35347 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crhr1P35347 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crhr1P35347 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crhr1P35347 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crhr1P35347 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crhr1P35347 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Crhr1P35347 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crhr1P35347 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crhr1P35347 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crhr1P35347 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crhr1P35347 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crhr1P35347 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crhr1P35347 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crhr1P35347 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crhr1P35347 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crhr1P35347 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crhr1P35347 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crhr1P35347 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crhr1P35347 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crhr1P35347 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crhr1P35347 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crhr1P35347 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crhr1P35347 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crhr1P35347 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crhr1P35347 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crhr1P35347 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crhr1P35347 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms