Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoc3P33622 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoc3P33622 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoc3P33622 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoc3P33622 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoc3P33622 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoc3P33622 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoc3P33622 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoc3P33622 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoc3P33622 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoc3P33622 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoc3P33622 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apoc3P33622 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoc3P33622 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoc3P33622 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoc3P33622 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoc3P33622 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoc3P33622 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoc3P33622 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apoc3P33622 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoc3P33622 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoc3P33622 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoc3P33622 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoc3P33622 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoc3P33622 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoc3P33622 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoc3P33622 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoc3P33622 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoc3P33622 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoc3P33622 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoc3P33622 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoc3P33622 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apoc3P33622 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoc3P33622 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoc3P33622 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoc3P33622 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc3P33622 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoc3P33622 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoc3P33622 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoc3P33622 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoc3P33622 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoc3P33622 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoc3P33622 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoc3P33622 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoc3P33622 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoc3P33622 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoc3P33622 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoc3P33622 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoc3P33622 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoc3P33622 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apoc3P33622 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoc3P33622 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoc3P33622 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoc3P33622 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoc3P33622 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoc3P33622 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoc3P33622 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoc3P33622 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoc3P33622 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoc3P33622 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoc3P33622 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoc3P33622 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoc3P33622 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoc3P33622 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoc3P33622 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoc3P33622 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoc3P33622 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoc3P33622 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoc3P33622 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoc3P33622 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoc3P33622 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoc3P33622 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoc3P33622 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apoc3P33622 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoc3P33622 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms