Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
PtprmP28828 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
PtprmP28828 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
PtprmP28828 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PtprmP28828 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
PtprmP28828 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PtprmP28828 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PtprmP28828 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PtprmP28828 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PtprmP28828 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PtprmP28828 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PtprmP28828 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PtprmP28828 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PtprmP28828 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PtprmP28828 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PtprmP28828 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PtprmP28828 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PtprmP28828 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PtprmP28828 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PtprmP28828 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PtprmP28828 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PtprmP28828 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
PtprmP28828 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PtprmP28828 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PtprmP28828 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PtprmP28828 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
PtprmP28828 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PtprmP28828 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PtprmP28828 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PtprmP28828 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PtprmP28828 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PtprmP28828 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PtprmP28828 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PtprmP28828 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PtprmP28828 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PtprmP28828 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PtprmP28828 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PtprmP28828 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PtprmP28828 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
PtprmP28828 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
PtprmP28828 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PtprmP28828 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PtprmP28828 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
PtprmP28828 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PtprmP28828 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PtprmP28828 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PtprmP28828 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PtprmP28828 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PtprmP28828 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PtprmP28828 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PtprmP28828 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PtprmP28828 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PtprmP28828 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PtprmP28828 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PtprmP28828 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PtprmP28828 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PtprmP28828 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
PtprmP28828 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PtprmP28828 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PtprmP28828 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PtprmP28828 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PtprmP28828 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PtprmP28828 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PtprmP28828 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PtprmP28828 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
PtprmP28828 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PtprmP28828 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PtprmP28828 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PtprmP28828 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PtprmP28828 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PtprmP28828 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PtprmP28828 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PtprmP28828 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PtprmP28828 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
PtprmP28828 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PtprmP28828 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PtprmP28828 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PtprmP28828 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PtprmP28828 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PtprmP28828 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PtprmP28828 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
PtprmP28828 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PtprmP28828 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PtprmP28828 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PtprmP28828 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PtprmP28828 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PtprmP28828 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PtprmP28828 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PtprmP28828 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PtprmP28828 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
PtprmP28828 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PtprmP28828 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PtprmP28828 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PtprmP28828 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PtprmP28828 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PtprmP28828 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PtprmP28828 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PtprmP28828 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
PtprmP28828 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PtprmP28828 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
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