Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sept4P28661 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sept4P28661 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sept4P28661 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sept4P28661 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Sept4P28661 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Sept4P28661 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sept4P28661 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sept4P28661 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sept4P28661 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sept4P28661 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sept4P28661 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sept4P28661 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sept4P28661 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sept4P28661 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Sept4P28661 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sept4P28661 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sept4P28661 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sept4P28661 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sept4P28661 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sept4P28661 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sept4P28661 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sept4P28661 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sept4P28661 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Sept4P28661 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sept4P28661 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sept4P28661 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sept4P28661 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sept4P28661 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sept4P28661 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sept4P28661 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sept4P28661 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sept4P28661 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sept4P28661 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sept4P28661 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sept4P28661 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sept4P28661 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sept4P28661 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sept4P28661 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sept4P28661 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sept4P28661 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sept4P28661 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sept4P28661 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sept4P28661 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sept4P28661 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sept4P28661 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sept4P28661 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sept4P28661 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sept4P28661 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sept4P28661 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sept4P28661 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sept4P28661 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sept4P28661 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sept4P28661 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sept4P28661 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sept4P28661 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sept4P28661 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sept4P28661 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sept4P28661 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sept4P28661 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sept4P28661 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sept4P28661 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sept4P28661 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sept4P28661 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Sept4P28661 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sept4P28661 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sept4P28661 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sept4P28661 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Sept4P28661 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sept4P28661 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sept4P28661 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sept4P28661 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sept4P28661 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sept4P28661 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sept4P28661 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sept4P28661 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Sept4P28661 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sept4P28661 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sept4P28661 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Sept4P28661 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sept4P28661 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sept4P28661 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sept4P28661 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sept4P28661 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sept4P28661 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sept4P28661 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sept4P28661 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sept4P28661 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sept4P28661 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sept4P28661 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sept4P28661 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sept4P28661 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sept4P28661 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sept4P28661 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Sept4P28661 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sept4P28661 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sept4P28661 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sept4P28661 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Sept4P28661 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sept4P28661 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms