Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DcnP28654 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DcnP28654 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DcnP28654 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DcnP28654 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DcnP28654 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DcnP28654 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DcnP28654 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DcnP28654 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DcnP28654 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DcnP28654 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcnP28654 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcnP28654 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcnP28654 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcnP28654 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DcnP28654 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DcnP28654 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DcnP28654 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DcnP28654 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DcnP28654 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DcnP28654 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DcnP28654 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DcnP28654 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DcnP28654 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DcnP28654 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DcnP28654 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DcnP28654 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DcnP28654 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DcnP28654 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcnP28654 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcnP28654 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcnP28654 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DcnP28654 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DcnP28654 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DcnP28654 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcnP28654 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcnP28654 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcnP28654 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcnP28654 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcnP28654 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcnP28654 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcnP28654 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DcnP28654 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DcnP28654 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DcnP28654 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DcnP28654 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcnP28654 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcnP28654 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DcnP28654 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DcnP28654 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcnP28654 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcnP28654 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcnP28654 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcnP28654 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DcnP28654 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DcnP28654 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DcnP28654 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DcnP28654 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcnP28654 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DcnP28654 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcnP28654 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcnP28654 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcnP28654 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DcnP28654 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcnP28654 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcnP28654 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcnP28654 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DcnP28654 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DcnP28654 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DcnP28654 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DcnP28654 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DcnP28654 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcnP28654 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcnP28654 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcnP28654 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcnP28654 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DcnP28654 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DcnP28654 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DcnP28654 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DcnP28654 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DcnP28654 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DcnP28654 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DcnP28654 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DcnP28654 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DcnP28654 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DcnP28654 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DcnP28654 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcnP28654 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcnP28654 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcnP28654 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DcnP28654 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DcnP28654 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DcnP28654 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcnP28654 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcnP28654 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcnP28654 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DcnP28654 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DcnP28654 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DcnP28654 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DcnP28654 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms