Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Defa5P28312 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Defa5P28312 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Defa5P28312 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Defa5P28312 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa5P28312 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa5P28312 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa5P28312 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa5P28312 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa5P28312 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa5P28312 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa5P28312 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defa5P28312 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa5P28312 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa5P28312 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa5P28312 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa5P28312 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa5P28312 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa5P28312 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa5P28312 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa5P28312 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa5P28312 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa5P28312 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa5P28312 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa5P28312 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa5P28312 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa5P28312 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa5P28312 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa5P28312 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa5P28312 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa5P28312 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa5P28312 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa5P28312 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa5P28312 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Defa5P28312 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Defa5P28312 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa5P28312 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms