Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmb9P28076 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmb9P28076 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmb9P28076 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmb9P28076 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmb9P28076 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmb9P28076 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmb9P28076 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmb9P28076 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmb9P28076 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmb9P28076 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmb9P28076 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmb9P28076 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmb9P28076 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmb9P28076 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmb9P28076 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmb9P28076 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmb9P28076 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmb9P28076 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmb9P28076 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmb9P28076 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmb9P28076 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmb9P28076 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmb9P28076 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmb9P28076 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmb9P28076 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmb9P28076 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmb9P28076 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmb9P28076 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmb9P28076 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmb9P28076 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmb9P28076 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmb9P28076 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmb9P28076 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmb9P28076 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmb9P28076 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmb9P28076 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmb9P28076 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmb9P28076 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmb9P28076 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmb9P28076 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmb9P28076 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmb9P28076 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmb9P28076 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmb9P28076 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmb9P28076 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmb9P28076 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmb9P28076 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmb9P28076 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmb9P28076 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmb9P28076 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmb9P28076 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmb9P28076 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmb9P28076 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmb9P28076 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmb9P28076 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmb9P28076 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmb9P28076 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmb9P28076 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmb9P28076 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmb9P28076 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmb9P28076 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmb9P28076 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmb9P28076 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmb9P28076 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmb9P28076 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmb9P28076 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmb9P28076 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmb9P28076 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psmb9P28076 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmb9P28076 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmb9P28076 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms