Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lef1P27782 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lef1P27782 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lef1P27782 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lef1P27782 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lef1P27782 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lef1P27782 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lef1P27782 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lef1P27782 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lef1P27782 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lef1P27782 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lef1P27782 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lef1P27782 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lef1P27782 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lef1P27782 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lef1P27782 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lef1P27782 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lef1P27782 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lef1P27782 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lef1P27782 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lef1P27782 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lef1P27782 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lef1P27782 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lef1P27782 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lef1P27782 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lef1P27782 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lef1P27782 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lef1P27782 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lef1P27782 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lef1P27782 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lef1P27782 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lef1P27782 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lef1P27782 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lef1P27782 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lef1P27782 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lef1P27782 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lef1P27782 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lef1P27782 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lef1P27782 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lef1P27782 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lef1P27782 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lef1P27782 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lef1P27782 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms