Protein–RNA interactions for Protein: P26952

Il3ra, Interleukin-3 receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il3raP26952 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il3raP26952 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il3raP26952 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il3raP26952 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il3raP26952 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il3raP26952 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il3raP26952 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Il3raP26952 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Il3raP26952 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Il3raP26952 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il3raP26952 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Il3raP26952 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Il3raP26952 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il3raP26952 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il3raP26952 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Il3raP26952 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Il3raP26952 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il3raP26952 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Il3raP26952 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Il3raP26952 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Il3raP26952 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Il3raP26952 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Il3raP26952 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Il3raP26952 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Il3raP26952 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Il3raP26952 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Il3raP26952 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Il3raP26952 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Il3raP26952 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Il3raP26952 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Il3raP26952 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Il3raP26952 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Il3raP26952 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Il3raP26952 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Il3raP26952 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Il3raP26952 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Il3raP26952 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Il3raP26952 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Il3raP26952 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms