Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Edn1P22387 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edn1P22387 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edn1P22387 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edn1P22387 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Edn1P22387 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Edn1P22387 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Edn1P22387 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edn1P22387 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edn1P22387 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edn1P22387 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edn1P22387 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edn1P22387 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edn1P22387 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edn1P22387 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edn1P22387 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edn1P22387 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edn1P22387 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edn1P22387 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Edn1P22387 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Edn1P22387 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Edn1P22387 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Edn1P22387 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Edn1P22387 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Edn1P22387 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Edn1P22387 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Edn1P22387 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Edn1P22387 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Edn1P22387 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Edn1P22387 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Edn1P22387 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Edn1P22387 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Edn1P22387 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Edn1P22387 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Edn1P22387 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Edn1P22387 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Edn1P22387 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Edn1P22387 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Edn1P22387 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Edn1P22387 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Edn1P22387 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Edn1P22387 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Edn1P22387 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Edn1P22387 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Edn1P22387 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Edn1P22387 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Edn1P22387 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Edn1P22387 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Edn1P22387 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Edn1P22387 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Edn1P22387 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Edn1P22387 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Edn1P22387 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Edn1P22387 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Edn1P22387 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edn1P22387 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edn1P22387 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edn1P22387 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Edn1P22387 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms