Protein–RNA interactions for Protein: P19788

Mgp, Matrix Gla protein, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgpP19788 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MgpP19788 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MgpP19788 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MgpP19788 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MgpP19788 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MgpP19788 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MgpP19788 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MgpP19788 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MgpP19788 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MgpP19788 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MgpP19788 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MgpP19788 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MgpP19788 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MgpP19788 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MgpP19788 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MgpP19788 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MgpP19788 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MgpP19788 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MgpP19788 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MgpP19788 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MgpP19788 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MgpP19788 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MgpP19788 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MgpP19788 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MgpP19788 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MgpP19788 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MgpP19788 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MgpP19788 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MgpP19788 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MgpP19788 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MgpP19788 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MgpP19788 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MgpP19788 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MgpP19788 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MgpP19788 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MgpP19788 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MgpP19788 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MgpP19788 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MgpP19788 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MgpP19788 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MgpP19788 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MgpP19788 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MgpP19788 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MgpP19788 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MgpP19788 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MgpP19788 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MgpP19788 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MgpP19788 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MgpP19788 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MgpP19788 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MgpP19788 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MgpP19788 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MgpP19788 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MgpP19788 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MgpP19788 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MgpP19788 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MgpP19788 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MgpP19788 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MgpP19788 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MgpP19788 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MgpP19788 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MgpP19788 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MgpP19788 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MgpP19788 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MgpP19788 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MgpP19788 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MgpP19788 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MgpP19788 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MgpP19788 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MgpP19788 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MgpP19788 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MgpP19788 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MgpP19788 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MgpP19788 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MgpP19788 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MgpP19788 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MgpP19788 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MgpP19788 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MgpP19788 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MgpP19788 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MgpP19788 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MgpP19788 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MgpP19788 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MgpP19788 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MgpP19788 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MgpP19788 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MgpP19788 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MgpP19788 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MgpP19788 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MgpP19788 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MgpP19788 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MgpP19788 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MgpP19788 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MgpP19788 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MgpP19788 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MgpP19788 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MgpP19788 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MgpP19788 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MgpP19788 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MgpP19788 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms